米Microsoft、オープンソースのバイオインフォマティクス向けツールキットを公開

 米Microsoftは7月15日、オープンソースのバイオインフォマティックス・ツールキット「Microsoft Biology Foundation(MBF)」を公開した。まずはゲノム解析・研究をターゲットにするという。

 MBFは、Microsoftの研究機関であるMicrosoft Researchで研究が進んでいる言語独立型のバイオインフォマティックスツールキット。拡張性、クロスプラットフォームなどの特徴を持つ。Microsoft Researchは、MBFと「Microsoft Biology Tools(MBI)」の2つの柱を持つ「Microsoft Biology Initiative」を展開している。

 「.NET Framework」の拡張として構築されており、バイオインフォマティックスのファイルフォーマット向けパーサー、DNA、RNA、たんぱく質配列を操作するアルゴリズム、生物学のWebサービスとのコネクタセットを実装する。Webサービスには、米国立生物工学情報センター(NCBI)のBLASTアルゴリズム実装「NCBI BLAST」などが含まれる。

 MBFはMicrosoft ResearchのBiology Initiativeプロジェクトページよりダウンロードできる。

米Microsoft
http://www.microsoft.com/

Microsoft Biology Initiative
http://research.microsoft.com/en-us/projects/bio/

Microsoft Biology Initiativeプロジェクトページ
http://mbf.codeplex.com/